中国科学技术期刊编辑学会筹备于1981年，1986年10月30日国家科委（1986）第0758号文批复中国科协同意成立中国科学技术期刊编辑学会，12月4日中国科协（1986）第418号文正式接纳中国科学技术期刊编辑学会加入中国科协。1987年3月5日我会正式成立。

1987年3月5日，我会第1次会员代表大会在北京召开，翁永庆当选为理事长，鲁星当选为秘书长。

1991年4月14日至18日，我会第2次全国会员代表大会在江苏无锡举行，翁永庆当选为理事长，丁乃刚当选为秘书长。

1995年6月15日至21日，我会第3次全国会员代表大会在山东长岛召开，孙枢院士当选为理事长，何世沅当选为秘书长。

2000年9月11日至14日，我会第4次全国会员代表大会在北京举行，丁乃刚当选为理事长，李军当选为秘书长。

2004年9月6日至9日，我会第5次全国会员代表大会在北京举行，丁乃刚当选为理事长，姚希彤当选为秘书长。

2015年8月5日，我会第6次全国会员代表大会在北京举行，朱邦芬当选为理事长，任胜利当选为秘书长。

2021年6月22日，我会第7次全国会员代表大会在北京举行，田伟当选为理事长，魏均民当选为秘书长。